丘腦是癲癇發生和傳播以及神經刺激和針灸治療的關鍵結構。針刺，迷走神經刺激，及三叉神經刺激等的傳入輸入可能引起足夠的抑制丘腦和皮質內的病理性振盪引起的癲癇發作和傳播。
針灸，如神經刺激程式，可以急性抑製或消除癲癇樣丘腦神經元活動，從而調節丘腦皮質振盪，並最終防止癲癇發作和傳播。另一方面，可能由重複刺激引起的針灸的慢性影響可能涉及通過複雜的轉錄和轉錄後調節突觸可塑性，神經遞質代謝或甚至神經重建的調節。因此，可以合理地得出結論，針灸可以作為一種有前景的療法，或者至少是一種篩查工具，在難治性癲癇的治療中為這些侵入性方式選擇合適的候選者。
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