自閉症兒童的最大障礙是語言發育遲緩，交往障礙。他們常常沉浸在封閉的自我世界中，究其原因是其缺乏或者沒有與外界交往的能力，這可能是因為自閉症兒童大腦語言中樞功能障礙。現代醫學研究發現，自閉症患兒額區和顳區血流量明顯減少。而大腦額葉與智力關係最為密切，顳葉為語言中樞所在。現代許多人體研究證明，針灸能肯定地促進大腦語言中樞的新陳代謝，改善語言中樞的功能。而我們所用的靳三針療法之“智三針”就位於大腦額葉的投影區，顳三針則位於語言中樞的投影範圍。有關研究表明，針刺人中、神門、內關、湧泉等穴位（這些穴位是我們的手智針、足智針的重要組成穴位），可促進腦組織的修復，調整血流變功能，改善腦血循環，同時使神經衝動傳導加快，增加大腦皮層突觸數量與品質，從而改善智力水準。簡而言之，這些穴位具有醒神開竅的作用。而舌針、舌三針則可明顯改善各種原因導致的大腦損傷所引起的語言障礙。
雖然針灸不能讓自閉症患兒徹底痊癒，但針灸能改善自閉症兒童大腦的功能，開發其大腦潛在智力，尤其是語言能力，提高自閉症患者的學習能力，讓他們能更好地接受訓練，提高生活自理能力與社會交往能力。簡單地說，針灸可使自閉症小作醒神開竅。 (這對於症狀較重的自閉症患兒不失為一一種更為有效的治療方法)，例如在智力方面，通過利用生化學、電生理學、分子生物學等技術，通過SPEC發現：自閉症患兒額區和顳區血流量明顯減少，而現代醫學認為智力與大腦額葉關係最為密切。而我們所用的靳三針療法之“智三針”的位置就相當於大腦額葉的投影區。有關研究表明，針刺’神門’等穴位，可促進腦組織的修復，調整血流變功能，改善腦血循環，同時使神經衝動傳導加快，增加大腦皮層突觸數量與品質，從而改善智力水準。